Kuidas Dna-Esialgne Testid Tõesti Toimivad?

{h1}

23andme, ancestry.com ja muud teenused lubavad avada geneetilises koodis peidetud esialgse saladuse. Aga kuidas nad töötavad?

Hiljuti olid tänapäeval laialdaselt kättesaadavad geneetilised testid düstopia teadusliku fiktsiooni valdkonnaks. Nüüd on nad kena kingitus oma sünnipäevaks oma genealoogiapõhise tädi ostmiseks.

Sellised firmad nagu 23andMe, Ancestry.com ja National Geographic turustavad neid kodus DNA testimise komplektides, pakkudes oma geneetilisi saladusi avama grupiviisilise õhtusöögi hinna mõnusas restoranis ja ligikaudu poole tassi spoonist.

Ja kuigi aeg oli siis, kui neid katseid turustati peamiselt tervishoiuteenuste - haiguste testimise ja keha paremaks mõistmiseks -, on nende markeeringu aspektid osaliselt vähenenud, osaliselt tänu Ameerika Ühendriikide seadusandjate tegevusele. Tänapäeval asuvad enamus suured geneetilise testimise firmad ennekõike esivanemate teenustena, lubades nii kaua kadunud sugulasi ühendada kui ka selgitada kasutajatele, millised maailma osad olid nende esivanemad.

Osta 23andMe Amazon.com'is

Osta AncestryDNA Amazon.com-is

Osta Nat Geo DNA testikomplekti Amazon.com

"Esirääkimiste teenus on funktsioonide kogu, mis annavad teile põhjaliku ülevaate oma ajaloost, alates väga muistsest minevikust, 60 000 aastat tagasi neandertaalidega, kuni viimase ajani", ütles Robin Smith, kes juhib 23andMe esivanemisprogrammi.

Kliendid saadavad nendele ettevõtetele sülitamisproove. Siis, tavaliselt umbes kaks kuud hiljem, logivad nad oma kontodele, et leida personaliseeritud veebilehti koos informatsiooniga nagu Lõuna-Aasia päritolu protsent või Neanderthali päritolu või üksikasjad nende ema ja isa joonte kohta. [Parimad DNA katsekomplektid 2018. aastast]

Aga kuidas need teenused tegelikult töötavad kellegi esivanema kindlakstegemiseks?

Smith rääkis Live News'ile, et 23andMe kasutab neid tulemusi jõudmiseks mitmeid algoritme.

Kui DNA sipelgatud proovis on digiteeritud, näeb see välja nagu C, G, T ja A pikk string. Need on märgid, mis on antud neljale DNA nukleotiidile, kirjadele, millele on kirjutatud geenid.

See kirjade string oleks teile ja iseenesest arusaamatuks bioloogidele ja inseneridele, kes neid uurivad. Näiteks pole kirja string, mis tähendab "Šveitsi" või "Nigeeria". Kuid algoritmid võivad tõmmata tähtede stringi tähendusest välja, ütles Smith.

Need ettevõtted hoiavad oma algoritmide üksikasjad mõnevõrra salajasena. Aga see pole nii, et nende arvutid räägivad mõnda salajast keelt. Selle asemel on geomeetri Mark Stonekingi sõnul Max Plancki evolutsioonilise antropoloogia instituudi grupijuhiks Saksamaal tõeliselt tuntud mustrid.

"Need on tehnikad, mida teadlased on juba pikka aega teada saanud," ütles Stoneking WordsSideKick.com.

Ta kasutas nende meetodite versiooni oma teedrajavas töös, jälgides kõigi elavate inimeste ühist esimest, naist nimega "Mitochondrial Eve", kes elas umbes 200 000 aastat tagasi. Ja teadlased kasutavad endiselt neid meetodeid, et jälgida inimpopulatsioonide liikumist ja segunemist sügavast minevikust hiljutine ajalugu.

Kui geneetiline antropoloog omab DNA-proovi ja väga suurte teiste proovide raamatukogu, et seda võrrelda, saab see antropoloog kiiresti mõista, millised rühmad raamatukogus DNA-ga kõige tihedamalt seotud, Stoneking ütles.

"See on kindel meetod," lisas ta.

Säilivus

Teadlased suudavad jälgida isaduslikku esivanemist, vaadates Y-kromosoomi, millised isad lähevad oma meessoost lastele. Samuti võib emade päritolu leida mitokondrite DNA-st, mille emad läbivad kõik oma lapsed. Kõige rikkaim ja üksikasjalikum esialgne teave pärineb aga sellest, et võrrelda kõiki asju - 22 mitte-sugu kromosoomi - massiivsete raamatukogude vastu.

"Nii algoritm töötab, see võtab kogu genoomi ja lõikab seda üles," ütles Smith. "See võtab vähe tükke ja iga tüki puhul võrreldakse seda võrdlusandmete kogumiga. See võrdleb seda Britiga, võrreldakse seda Lääne-Aafrika vastu, läbib kogu loendi ja see eristab tõenäosust [kui see tükk DNA pärineb]. "

Niisiis, kui teie 23andMe test ütleb, et olete 29 protsenti Briti, seepärast, et 29 protsenti teie DNA-dest oli tõenäoliselt pärit rühmast, mille 23andMe viitekogu on märgitud "Briti".

Stonekingi sõnul pärinevad nendest esirigruppidest pärinevad enesearengute kombinatsioonid (paljud inimesed suudavad oma vahetut tausta päris hästi kirjeldada) ja sõltumatuid uuringuid. Seega, kui algoritm leiab, et 8000 inimest on pärit tihedast suguvõsakogukonnast ja teadlased teavad, et kõik need inimesed jälgivad oma pärandit Tais, võivad nad märgistada seda rühma "Tai".

Nagu kirjeldatud Stoneking ja Smith tunnistas, on probleem see, et need meetodid on nii head kui raamatukogud, mida teadlased peavad võrdlema DNA proovidega.

23andMe raamatukogude üksikasjad - nagu kõik tema peamised konkurendid - ei ole avalikud, kuid Smith ütles, et ettevõte saab pakkuda palju üksikasjalikumat teavet Euroopa populatsioonide (nende kõige enam valimisse kuuluvate rühmade kohta) kohta kui näiteks Põhja-Ameerika elanikkonnast (kõige vähem valimisse kuuluvate rühmade seas). Sellepärast võib esivanemate leht analüüsida iirlaselt anglo-saksoni või ashkenazi juudi poola poolest, kuid võib inuittide ja navaho ühendada ühtsesse kategooriasse.

Seega, kuigi aluseks olevad tööriistad on kehtivad, on laiade esialgsete andmete kvaliteedi piirid, ütles Stoneking.

Siiski on Stonekingi sõnul rohkem kindel teave, mida need firmad pakuvad, näiteks pikka kadunud sugulaste leidmine. Ettevõte ei vaja suurt raamatukogu, et teada saada, kas DNA proovid on pärit pereliikmetest; nad lihtsalt vajavad algoritme, mis on juba aastakümneid täiuslik.

Algselt avaldatud WordsSideKick.com.


Video Täiendada: .




ET.WordsSideKick.com
Kõik Õigused Reserveeritud!
Mistahes Materjalide Reprodutseerimine Lubatud Ainult Prostanovkoy Aktiivne Link Saidile ET.WordsSideKick.com

© 2005–2019 ET.WordsSideKick.com